タイトルがうまいこと思いつきませんでした。

解説はPhotoshopCCを使用しましたが、有料の画像ソフトの大半にはある機能

「透明ピクセルのロック」「クリッピング」を取り扱います。

無料ソフトでもこの機能があるソフトはあります。便利な機能なのでぜひ探してみてください。

また、ソフトによって名称が微妙に違う可能性があります。お使いのソフトと上記の単語で検索してみてください。

さっそく例を挙げてみましょう。

何も書かれていない、透明なレイヤーに丸を描きました。

この部分にだけ、影をつけたい。

まあ、こうなる。

そこで、

このチェック柄のボックスをクリックして、もう一度塗ってみましょう。

（ほかのソフトでも、この機能があるソフトでしたら必ずレイヤーメニューにあります）

このとおり、はみ出さずに塗ることができます。

下地の色を変えたり、影の色だけ変えたりする必要がなければ、これで十分なのですが、もう一つ方法があります。

別のレイヤーを作って、そこに影を描いてみました。

このままだと、やっぱりはみ出ています。そこで、

これを選択してみましょう。

大概の場合、上メニューの「レイヤータブ」及び、該当レイヤーの上で右クリックすると、このメニューが出てくると思います。

SAIでは、レイヤー一覧のところに、親切に「下のレイヤーでクリッピングする」という文字が用意されています。ここにチェックを入れましょう。

はみ出した部分が見えなくなりました。

レイヤーを分けたほうが、別の色を追加するときに便利ですね。

なお、ソフトによってはこのクリッピングをキーボードショートカットで行うことができるようになっています。

フォトショップなどでは、そのキーを使いやすいキーに変更することも可能です。

レイヤーを多く使うようになってきたら、ショートカットの使用も検討してみるといいと思います。